عنوان فارسی مقاله:ساختار کریستال یا بلورین دومین اتصال RNA پروتئین نوکلئوکپسید SARS-CoV-2 ، محل‌های هدف دارویی منحصر به فرد را نشان می‌دهد

چکیده

پیش زمینه و هدف: شیوع بیماری کروناویروس (COVID-19) در چین به دلیل ویروس SARS-CoV-2 منجر به بیماری و مرگ و میر قابل توجه در سراسر دنیا شده است. در حال حاضر هیچ روش درمانی خاصی برای پروتئین ویروسی وجود ندارد. پروتئین نوکلئوکپسید ویروسی یک هدف دارویی ضد ویروسی بالقوه است، که در طول چرخه زندگی ویروسی چندین عملکرد حیاتی را انجام می‌دهد. با این حال، اطلاعات ساختاری پروتئین نوکلئوکپسید SARS-CoV-2 همچنان نامشخص است.

روش‌ها: برای به دست آوردن اطلاعات ساختاری پروتئین نوکلئوکپسید SARS-CoV-2، ما ساختار کریستالی ۲٫۷ A از حوزه اتصال RNA N ترمینال پروتئین نوکلئوکپسید SARS-CoV-2 را با استفاده از فناوری کریستالوگرافی اشعه X تعیین کرده‌ایم. برای بررسی مکانیسم تعامل، ما مطالعات عملکردی را با استفاده از تجزیه و تحلیل تشدید پلاسمون سطح آزمایشگاهی و روش‌های تداخل اینترفرومتری دو لایه‌ای تکمیل کردیم(ساختار کریستال یا بلورین دومین).

نتایج: اگر چه ساختار کلی شبیه به دامنه N ترمینال پروتئین نوکلئوکپسید کرونا ویروس گزارش شده است، اما مشخصات پتانسیل الکترواستاتیک سطح بین آنها مشخص است. مقایسه بیشتر با دامنه معادل ویروس خفیف نوع HCoV-OC43، یک بسته اتصال RNA بالقوه منحصر به فرد در کنار هسته ورق b را نشان می‌دهد.

نتیجه گیری: داده‌های ما ویژگی‌های وضوح اتمیک دومین انتهای آمینی پروتئین نوکلئوکپسید SARS-CoV-2 و طراحی هدف یابی عوامل ضد ویروسی با SARS-CoV-2 را نشان داد.

ادامه مطلب

راهنمای خرید:

لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.

Title: Crystal structure of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein RNA binding domain reveals potential unique drug targeting sites

Abstract

Background: The outbreak of coronavirus disease (COVID-19) in China caused by the SARS-CoV-2 virus continually lead to worldwide human infections and deaths. It is currently no specific viral protein targeted therapeutics. Viral nucleocapsid protein is a potential antiviral drug target, serving multiple critical functions during the viral life cycle. However, the structural information of the SARSCoV-2 nucleocapsid protein remains unclear. Methods: To obtain the structural information of the SARS-CoV-2 nucleocapsid protein, we have determined the 2.7 A ˚ crystal structure of the N terminal RNA binding domain of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein using X-ray crystallography technology. To explored the interaction mechanism, we complemented functional studies by in vitro surface plasmon resonance analysis and biolayer interferometry assays. Results: Although the overall structure is similar to other reported coronavirus nucleocapsid protein Nterminal domain, the surface electrostatic potential characteristics between them are distinct. Further comparison with mild virus type HCoV-OC43 equivalent domain demonstrates a unique potential RNA binding pocket alongside the b-sheet core. Conclusions: Our data provide several atomic resolution features of the SARS-CoV-2 nucleocapsid protein N-terminal domain, guiding the design of novel antiviral agents specific targeting to SARS-CoV-2.