رایانه‌ها و بیماری‌های ویروسی. مطالعات اولیه بیوانفورماتیک

رایانه‌ها و بیماری‌های ویروسی. مطالعات اولیه بیوانفورماتیک

نوع فایل : word

تعداد صفحات : 50

تعداد کلمات : 17000

مجله : Computers in Biology and Medicine

انتشار : 2020

ترجمه ی متون جدول : ترجمه شده است

درج جداول در فایل ترجمه : درج شده است

منابع داخل متن : به صورت فارسی درج شده است

کیفیت ترجمه : طلایی

فونت ترجمه : ب نازنین 12

تاریخ انتشار
11 جولای 2020
دسته بندی
تعداد بازدیدها
2125 بازدید
39,000 تومان
دانلود اصل مقاله

عنوان فارسی مقاله:رایانه‌ها و بیماری‌های ویروسی. مطالعات اولیه بیوانفورماتیک در زمینه طراحی واکسن مصنوعی و یک آنتاگونیست پیشگیرانه پپتیدومیمیتیک در برابر کروناویروس SARS-CoV-2 )2019-nCoV، COVID-19)

چکیده

این مقاله به بررسی و مطالعه‌ی ایزوله‌ی حاصل از غذاهای دریایی ووهان که به نظر می‌رسد عامل اصلی بیماری COVID-19 باشد، می‌پردازد. هدف این مطالعه یافتن یک بخش کوتاه یا بخش‌هایی از توالی پروتئین ویروسی مناسب برای پیشنهاد اولیه طراحی یک واکسن مصنوعی پپتید و یک درمان پپتیدومتری، و کشف برخی از روش‌های طراحی واکسن است. این پروژه در ابتدا از زبان Q-UEL و اجرای آن در یک سیستم مدیریت دانش و سیستم استنتاج خودکار برای پزشکی به نام بیولنژین هدایت شده بود، اما تمرکز در اینجا بیشتر بر روی خود ویروس است. با این حال، با استفاده از سیستم‌های Q-UEL برای دسترسی به منابع مربوطه و نوظهور، و ارتباط برقرار کردن با ابزارهای بیوانفورماتیک استاندارد در دسترس عموم در اینترنت، سرعت شناسایی توالی اسیدهای آمینه که به خوبی در بسیاری از ویروسها از جمله ۲۰۱۹-nCoV حفظ می‌شوند، بهبود می‌یابد. KRSFIEDLLFNKV به خصوص در این مطالعه به خوبی حفظ شده و مطابقت با منطقه اطراف یکی از سایت‌های جدا شده از ویروس SARS است که اعتقاد بر این است که برای فعال سازی ویروس برای ورود به سلول لازم است. این موتیف توالی و تغییرات اطراف، مبنایی را برای پیشنهاد یک اپی توپ واکسن مصنوعی خاص و عامل پپتیدومتری تشکیل می‌دهند. با این حال، این کار را می‌توان در اصطلاحات سنتی بیوانفورماتیک توصیف کرد و، البته با این وصیت که داده‌ها و تحقیقات جدید در مورد ۲۰۱۹-nCoV با سرعت انفجاری در حال ظهور و تکامل است. مطالعات اولیه با استفاده از مدل سازی مولکولی و اتصال، و در آن زمینه مقدار بالقوه برخی از عصاره‌های گیاهی شناخته شده، نیز شرح داده شده است(رایانه‌ها و بیماری‌های ویروسی).

ادامه مطلب

راهنمای خرید:
  • لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
  • همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
  • ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
  • در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.

Title: Computers and viral diseases. Preliminary bioinformatics studies on the design of a synthetic vaccine and a preventative peptidomimetic antagonist against the SARS-CoV-2 (2019-nCoV, COVID-19) coronavirus

Abstract

This paper concerns study of the genome of the Wuhan Seafood Market isolate believed to represent the causative agent of the disease COVID-19. This is to find a short section or sections of viral protein sequence suitable for preliminary design proposal for a peptide synthetic vaccine and a peptidomimetic therapeutic, and to explore some design possibilities. The project was originally directed towards a use case for the Q-UEL language and its implementation in a knowledge management and automated inference system for medicine called the BioIngine, but focus here remains mostly on the virus itself. However, using Q-UEL systems to access relevant and emerging literature, and to interact with standard publically available bioinformatics tools on the Internet, did help quickly identify sequences of amino acids that are well conserved across many coronaviruses including 2019-nCoV. KRSFIEDLLFNKV was found to be particularly well conserved in this study and corresponds to the region around one of the known cleavage sites of the SARS virus that are believed to be required for virus activation for cell entry. This sequence motif and surrounding variations formed the basis for proposing a specific synthetic vaccine epitope and peptidomimetic agent. The work can, nonetheless, be described in traditional bioinformatics terms, and readily reproduced by others, albeit with the caveat that new data and research into 2019-nCoV is emerging and evolving at an explosive pace. Preliminary studies using molecular modeling and docking, and in that context the potential value of certain known herbal extracts, are also described.
    دیدگاهتان را بنویسید