توالی ژنوم کامل یک قارچ خوراکی و دارویی هریسیوم، Hericium erinaceus ،بازیدیومایکوتا

توالی ژنوم کامل یک قارچ خوراکی و دارویی هریسیوم، Hericium erinaceus ،بازیدیومایکوتا

نوع فایل : word

تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش : 12

تعداد کلمات : 5000

مجله : Genomics

انتشار : 2020

ترجمه متون داخل جداول : ترجمه شده است

درج جداول در فایل ترجمه : درج شده است

منابع داخل متن : به صورت فارسی درج شده است

کیفیت ترجمه : بالا

:

تاریخ انتشار
16 ژانویه 2022
دسته بندی
تعداد بازدیدها
1223 بازدید
29,000 تومان
دانلود اصل مقاله

عنوان فارسی مقاله:توالی ژنوم کامل یک قارچ خوراکی و دارویی هریسیوم، Hericium erinaceus ،بازیدیومایکوتا

چکیده

  Hericium erinaceus یک قارچ شناخته شده خوراکی و دارویی در چین است. مطالعات بیولوژیکی و ژنتیکی روی این قارچ نادر است و در نتیجه مانع از پرورش ارقام منتخب می شود. در اینجا، توالی‌یابی و تجمیع ژنوم H. erinaceus monokaryon CS-4 را با استفاده از پلتفرم Illumina و PacBio انجام دادیم. ژنوم تولید شده ۴۱٫۲ Mb با اندازه داربست N50 3.2 Mb بود و ۱۰۶۲۰ ژن پیش بینی شده احتمالی را کدگذاری می کرد. طیف گسترده ای از آنزیم های فعال کربوهیدرات، با تعداد کل ۳۴۱ CAZymes، که در تخریب لیگنوسلولز نقش دارند در H. erinaceus شناسایی شدند. در مجموع ۴۴۷ عامل رونویسی شناسایی شد. این مطالعه همچنین ریزماهواره‌های ژنومی را مشخص کرد و نشانگرهای H. erinaceus را توسعه داد. یک پایگاه داده جامع نشانگرهای ریزماهواره (HeSSRDb) حاوی اطلاعات ۹۰۴ نشانگر تولید شد. این منابع ژنومی و نشانگرهای مولکولی جدید طراحی شده، جعبه ابزار را برای مطالعات بیولوژیکی و ژنتیکی در H. erinaceus غنی می کند(قارچ خوراکی و دارویی هریسیوم).

ادامه مطلب

راهنمای خرید:
  • لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
  • همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
  • ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
  • در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.

Title: Whole genome sequence of an edible and medicinal mushroom, Hericium erinaceus (Basidiomycota, Fungi)

Abstract

 Hericium erinaceus is a well-known culinary and medicinal mushroom in China. The biological and genetic studies on this mushroom is rare, thereby hindering the breeding of elite cultivars. Herein, we performed de novo sequencing and assembly of H. erinaceus monokaryon CS-4 genome using the Illumina and PacBio platform. The generated genome was 41.2 Mb in size with a N50 scaffold size of 3.2 Mb, and encoded 10,620 putative predicted genes. A wide spectrum of carbohydrate-active enzymes, with the total number of 341 CAZymes, involved in lignocellulose degradation were identified in H. erinaceus. A total of 447 transcription factors were identified. This present study also characterized genome-wide microsatellites and developed markers in H. erinaceus. A comprehensive microsatellite markers database (HeSSRDb) containing the information of 904 markers was generated. These genomic resources and newly-designed molecular markers would enrich the toolbox for biological and genetic studies in H. erinaceus.