light box
امتیاز 2.58 مدل سازی و شبیه سازی انتخاب‌های فنوتیپی و ژنومی دوره‌ای">

نوع فایل : word
تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش : 21
تعداد کلمات : 7400
مجله : crop journal
انتشار : 2020
ترجمه متون داخل جداول : ترجمه شده است
درج جداول در فایل ترجمه : درج شده است
منابع داخل متن : به صورت فارسی درج شده است
کیفیت ترجمه : بالا
دسته بندی :
برچسب ها : ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ،

عنوان فارسی مقاله:مدل سازی و شبیه سازی انتخاب‌های فنوتیپی و ژنومی دوره‌ای در اصلاح نباتات تحت حضور اپیستازیس

چکیده

 انتخاب دوره‌ای یک روش اصلاح نباتات مهم برای اصلاح جمعیت و انتخاب اینبرد های  منتخب یا لاین های ثابت از ژرم پلاسم بهبود یافته است. اخیراً یک ابزار شبیه سازی کامپیوتری به نام QuMARS توسعه یافته است که امکان شبیه سازی و بهینه سازی استراتژی‌های مختلف انتخاب دوره‌ای را فراهم می‌کند. هدف اصلی ما در این مطالعه استفاده از ابزار QuMARS برای مقایسه انتخاب‌های دوره‌ای فنوتیپی، تکرارشونده به کمک نشانگر و ژنومی (به ترتیب PS، MARS و GS) برای روش‌های اصلاحی کوتاه‌مدت و بلندمدت بود. برای MARS، دو مدل انتخاب نشانگر در نظر گرفته شد، یعنی رگرسیون گام به گام (Rstep) و رگرسیون رو به جلو. برای GS، سه مدل پیش‌بینی در نظر گرفته شد، یعنی بهترین پیش‌بینی‌کننده‌های بی‌طرف خطی ژنومی (GBLUP)، رگرسیون (ریج)، و رگرسیون معکوس عمومی مور-پنروز (InverseMP). برای تولید ژنوتیپ‌ها و فنوتیپ‌ها برای یک فرد معین در طول شبیه‌سازی، یک مدل افزایشی و دو مدل ژنتیکی اپیستازیس با سه سطح وراثت‌پذیری در نظر گرفته شد. نتایج نشان داد که پاسخ‌های انتخاب از GS و MARS مبتنی بر GBLUP به طور مداوم بیشتر از پاسخ‌های PS تحت مدل افزایشی، به‌ویژه در چرخه‌های انتخاب اولیه بود. در مقابل، پاسخ انتخاب از PS به طور مداوم نسبت به MARS و GS تحت مدل‌های اپیستاتیک برتر بود. برای دو مدل اپیستازی، واریانس ژنتیکی کل و مؤلفه واریانس افزایشی در برخی موارد پس از انتخاب افزایش یافت. از طریق شبیه‌سازی، به این نتیجه رسیدیم که GS و PS روش‌های انتخاب دوره‌ای مؤثری برای بهبود اصلاح صفات هدف‌دار کنترل‌شده توسط جایگاه‌های صفت کمی افزایشی و اپیستاتیک (QTL) هستند. QuMARS فرصتی را برای اصلاح دهندگان فراهم می‌کند تا فناوری‌های جدید را با هم مقایسه، بهینه سازی و ادغام کنند تا در برنامه‌های اصلاحی مرسوم خود بگنجانند.

Title: Modeling and simulation of recurrent phenotypic and genomic selections in plant breeding under thepresence of epistasis

Abstract

 Recurrent selection is an important breeding method for population improvement and selecting elite inbreds or fixed lines from the improved germplasm. Recently, a computer simulation tool called QuMARS has been developed, which allows the simulation and optimization of various recurrent selection strategies. Our major objective in this study was to use the QuMARS tool to compare phenotypic recurrent, marker-assisted recurrent, and genomic selections (abbreviated respectively as PS, MARS and GS) for both short- and long- term breeding procedures. For MARS, two marker selection models were considered, i.e., stepwise (Rstep) and forward regressions (Forward). For GS, three prediction models were considered, i.e., genomic best linear unbiased predictors (GBLUP), ridge regression (Ridge), and regression by Moore-Penrose general inverse (InverseMP). To generate genotypes and phenotypes for a given individual during simulation, one additive and two epistasis genetic models were considered with three levels of heritability. Results demonstrated that selection responses from GBLUP-based GS and MARS (Forward) were consistently greater than those from PS under the additive model, particularly in early selection cycles. In contrast, selection response from PS was consistently superior over MARS and GS under epistatic models. For the two epistasis models, total genetic variance and the additive variance component were increased in some cases after selection. Through simulation, we concluded that GS and PS were effective recurrent selection methods for improved breeding of targeted traits controlled by additive and epistatic quantitative trait loci (QTL). QuMARS provides an opportunity for breeders to compare, optimize and integrate new technology into their conventional breeding programs.

دیدگاهها بسته است.

محصولات مشابه
کمبود(نقص) توجه و علائم ADHD در بزرگسالان مبتلا به بیماری فابری – یک مطالعه آزمایشی
خـریـد محـصـول
مرزهای جدید در مدیریت سرطان رکتوم اولیه و پیشرفته
خـریـد محـصـول
ریسک میوکاردیت و پریکاردیت در بزرگسالان جوان به دنبال واکسیناسیون mRNA COVID-19
خـریـد محـصـول
بروز میوکاردیت و پریکاردیت در بیماران واکسینه نشده پس از کووید-۱۹
خـریـد محـصـول
الگوریتم ازدحام آفتاب پرست کارآمد برای مسئله توزیع بار اقتصادی
خـریـد محـصـول
فرآیند بازآفرینی شهری: مورد یک مجتمع مسکونی در حومه رم، ایتالیا
خـریـد محـصـول
رابطه پویا بین شاخص سهام و قیمت دارایی: تجزیه و تحلیل بلندمدت
خـریـد محـصـول
تشخیص بیماری پوسیدگی طوقه در گندم در شرایط محیطی کنترل شده
خـریـد محـصـول
بکارگیری بهینه سازی برای حمایت از مدیریت تطبیقی آب رودخانه ها
خـریـد محـصـول
ارزیابی تأثیر آموزش زیست محیطی بر رفتار سازگار با محیط زیست
خـریـد محـصـول
ثبت اختراع یا انتشار مقاله

در اولین مرحله از شروع یک تحقیق جدید نیاز است منابع مختلفی جستجو شود تا جدید بودن ایده مورد بررسی قرار گیرد. یکی از بهترین منابع جهت جستجو، لیست اختراع های ثبت شده است. پایگاه های جستجوی پتنت به محقق کمک میکند پیشینه تحقیق خود را مورد بررسی قرار دهد تا مطمئن شود کار تکراری انجام نمیدهد. سامانه جستجوگر مالکیت فکری دارکوب به تازگی از پایگاه جستجو علائم تجاری خود نیز رونمایی کرده است که دارای امکانات تخصصی فراوانی می باشد.

ثبت اختراع یا انتشار مقاله کدام اول باید انجام شود؟ پژوهشگران منابع مالی و غیر مالی بسیاری را صرف انجام تحقیقات و پژوهش ها میکنند و امکان دارد تعدادی از آنها تبدیل به دستاوردها و فناوری های نو گردد. محققان این نتایج را به سرعت در مقالات علمی ملی و بین المللی منتشر و به آن افتخار میکنند. اما باید مد نظر داشت، چنانچه دستاورد پژوهشی امکان تبدیل شدن به یک محصول یا فرآیند قابل استفاده و تولید در صنعت را داشته باشد، هر گونه انتشار عمومی از جمله مقاله باعث از دست رفتن شرط جدید بودن و در نتیجه عدم امکان ثبت فناوری به عنوان اختراع خواهد شد.

در نتیجه محققان و پژوهشگران باید پیش از هرگونه افشاء عمومی آن دسته از نتایج تحقیقاتی که شرایط ثبت اختراع را دارا می باشد به صورت اظهارنامه اختراع در اداره مربوطه ثبت و سپس نسبت به انتشار آنها اقدام کنند. امکان دارد مراحل ثبت اختراع چندین ماه به طول بیانجامد که انتشار مقاله (و مانند آن) پس از تاریخ ثبت اظهارنامه اختراع مشکلی را در فرآیند ثبت اختراع بوجود نمی آورد.

از آنجا که برخی دستاورد ها مانند روشهای تشخیص بیماری و نوآوری های مدیریتی قابلیت ثبت اختراع بین المللی و ملی را ندارند، محققان بدون نگرانی میتوانند انتشار در مقالات داخلی و خارجی را به عنوان اولین گزینه جهت کسب افتخار دست یابی به این قبیل پژوهشها انتخاب کنند.

 
برو بالا