light box
امتیاز 2.58 آمینوگلیکوزیدها به عنوان مهارکننده های بالقوه پروتئاز اصلی SARS-CoV-2: یک مطالعه موردی">

نوع فایل : word
تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش : 15
تعداد کلمات : 5900
مجله : Journal of Infection and Public Health
انتشار : 2021
ترجمه متون داخل جداول : ترجمه شده است
درج جداول در فایل ترجمه : درج شده است
منابع داخل متن : به صورت فارسی درج شده است
کیفیت ترجمه : طلایی
دسته بندی :
برچسب ها : ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، ،

عنوان فارسی مقاله:آمینوگلیکوزیدها به عنوان مهارکننده های بالقوه پروتئاز اصلی SARS-CoV-2: یک مطالعه موردی  کامپیوتری در مورد داروهای ضد ویروسی و ضد عفونت تایید شده توسط FDA

 چکیده

  زمینه و هدف: ظهور و گسترش SARS-CoV-2 در سراسر جهان تأثیر اقتصادی-اجتماعی بسیار زیادی ایجاد کرده است. اگرچه چندین گزینه امیدوار کننده دارویی در آزمایشات بالینی وجود دارد ، اما هیچ یک از نظر بالینی در دسترس نیست. بنابراین ، رویکرد تجدید هدف دارو می تواند به غلبه بر بیماری همه گیر کنونی کمک کند. روش ها: پروتئاز اصلی  Mpro  SARS-CoV-2 برای تجزیه زنجیره های پلی پپتیدی نوپای بسیار مهم است. در اینجا ، داروهای ضد ویروسی و ضد عفونت مورد تأیید FDA با غربالگری مجازی با توان عملیاتی بالا (HTVS) و به دنبال آن اتصال مجدد با اتصال استاندارد مولکولی با دقت استاندارد (SP) و فوق العاده دقیق (XP) غربالگری شدند. اتصال قوی ترین دارو با محاسبات انرژی آزاد (Prime / MM-GBSA) و شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) بیشتر تأیید شد.

یافته ها: از ۱۳۹۷ داروی احتمالی ، ۱۵۷ مورد از نظر آماری حساسیت قابل توجهی نسبت به Mpro داشتند. پس از اتصال مولکولی HTVS ، SP و XP ، چهار داروی سرب دار با قدرت بالا (Iodixanol ، Amikacin ، Troxerutin و Rutin) با انرژی اتصال ۱۰٫۶۲۹ to تا ۷۷۱۱٫۷۷۶ کیلوکالری بر مول ، شناسایی شدند. در میان آنها ، آمیکاسین کمترین انرژی Prime / MM-GBSA (73.800 کیلوکالری در مول) را به نمایش گذاشت. این امر ما را بر آن داشت تا سایر آمینوگلیكوزیدها (نئومایسین ، پارامومایسین ، جنتامایسین ، استرپتومایسین و توبرامایسین) را در برابر Mpro ارزیابی كنیم. همه طرفین آمینوگلیکو به محل اتصال بستر Mpro متصل شده و با باقی مانده های مهم ارتباط برقرار می کنند. در مجموع ، آمیكاسین قوی ترین مهاركننده Mpro شناخته شد. شبیه سازی MD از مجموعه آمیکاسین-Mpro ، تشکیل یک مجموعه تثبیت شده توسط پیوندهای هیدروژن ، پل های نمکی و فعل و انفعالات ون در والس را پیشنهاد می کند(مهارکننده های بالقوه پروتئاز اصلی SARS-CoV-2).

نتیجه گیری: آمینوگلیکوزیدها ممکن است به عنوان داربست برای طراحی مولکول های دارویی قوی علیه COVID-19 عمل کنند. با این حال ، اعتبار بیشتر توسط مطالعات درون تنی و برون تنی قبل از استفاده از آمینوگلیکوزیدها به عنوان یک عامل ضد COVID-19 مورد نیاز است.

Title: Aminoglycosides as potential inhibitors of SARS-CoV-2 main protease: an in silico drug repurposing study on FDA-approved antiviral and anti-infection agents

Abstract

 Background: The emergence and spread of SARS-CoV-2 throughout the world has created an enormous socioeconomic impact. Although there are several promising drug candidates in clinical trials, none is available clinically. Thus, the drug repurposing approach may help to overcome the current pandemic. Methods: The main protease (Mpro) of SARS-CoV-2 is crucial for cleaving nascent polypeptide chains. Here, FDA-approved antiviral and anti-infection drugs were screened by high-throughput virtual screening (HTVS) followed by re-docking with standard-precision (SP) and extra-precision (XP) molecular docking. The most potent drug’s binding was further validated by free energy calculations (Prime/MM-GBSA) and molecular dynamics (MD) simulation. Results: Out of 1397 potential drugs, 157 showed considerable affinity toward Mpro. After HTVS, SP, and
XP molecular docking, four high-affinity lead drugs (Iodixanol, Amikacin, Troxerutin, and Rutin) with docking energies −10.629 to −11.776 kcal/mol range were identified. Among them, Amikacin exhibited the lowest Prime/MM-GBSA energy (−73.800 kcal/mol). It led us to evaluate other aminoglycosides (Neomycin, Paramomycin, Gentamycin, Streptomycin, and Tobramycin) against Mpro. All aminoglycosides were bound to the substrate-binding site of Mpro and interacted with crucial residues. Altogether, Amikacin was found to be the most potent inhibitor of Mpro. MD simulations of the Amikacin-Mpro complex suggested the formation of a complex stabilized by hydrogen bonds, salt bridges, and van der Waals interactions. Conclusion: Aminoglycosides may serve as a scaffold to design potent drug molecules against COVID-19. However, further validation by in vitro and in vivo studies is required before using aminoglycosides as an anti-COVID-19 agent.

دیدگاهها بسته است.

محصولات مشابه
بررسی فناوری بلاک چین در تجارت بین المللی.مهندسی مجدد فرایند کسب و کار برای اعتبارنامه
خـریـد محـصـول
قرارداد ببندیم یا نبندیم: نگرش از طریق روایت مالیات و هزینه
خـریـد محـصـول
هوش اعتباری: نوآوری در مدیریت برند از طریق داده های رسانه های اجتماعی
خـریـد محـصـول
تجویز آستاکسانتین به عنوان یک داروی نوروپروتکتیو مناسب برای درمان امراض نورولوژیک
خـریـد محـصـول
مقایسه بانک‌های محلی، ملی و بین المللی از نظر ارزیابی اثر منابع ارتباطی
خـریـد محـصـول
یکپارچگی لاینفک روح و جسم: نظریه و چشم انداز مکتب سایکوسوماتیک پاریس
خـریـد محـصـول
تجزیه و تحلیل ریسک بدهی شرکت های غیر مالی با استفاده از شبکه های دو لایه ای
خـریـد محـصـول
دسته بندی اطلاعات و داده‌ها با استفاده از ماشین بردار پشتیبان
خـریـد محـصـول
استفاده از روش های نوین برای پیاده سازی روان درمانی اینترنتی
خـریـد محـصـول
استفاده از آزمون‌های برشی برای سنجش مقاومت و استحکام خاک
خـریـد محـصـول
ثبت اختراع یا انتشار مقاله

در اولین مرحله از شروع یک تحقیق جدید نیاز است منابع مختلفی جستجو شود تا جدید بودن ایده مورد بررسی قرار گیرد. یکی از بهترین منابع جهت جستجو، لیست اختراع های ثبت شده است. پایگاه های جستجوی پتنت به محقق کمک میکند پیشینه تحقیق خود را مورد بررسی قرار دهد تا مطمئن شود کار تکراری انجام نمیدهد. لیست اختراعات ثبت شده در اداره ثبت اختراعات ایران دارای طبقه بندی های متفاوتی است. در طبقه بندی بین المللی B که شامل اختراعات حوزه نیاز ها بشری شامل عملیات اجرایی، حمل و نقل شامل: کشتیرانی، ترابری و دیگر موارد را میتوانید در پایگاه جستجوی دارایی های فکری دارکوب مشاهده کنید.

ثبت اختراع یا انتشار مقاله کدام اول باید انجام شود؟ پژوهشگران منابع مالی و غیر مالی بسیاری را صرف انجام تحقیقات و پژوهش ها میکنند و امکان دارد تعدادی از آنها تبدیل به دستاوردها و فناوری های نو گردد. محققان این نتایج را به سرعت در مقالات علمی ملی و بین المللی منتشر و به آن افتخار میکنند. اما باید مد نظر داشت، چنانچه دستاورد پژوهشی امکان تبدیل شدن به یک محصول یا فرآیند قابل استفاده و تولید در صنعت را داشته باشد، هر گونه انتشار عمومی از جمله مقاله باعث از دست رفتن شرط جدید بودن و در نتیجه عدم امکان ثبت فناوری به عنوان اختراع خواهد شد.

در نتیجه محققان و پژوهشگران باید پیش از هرگونه افشاء عمومی آن دسته از نتایج تحقیقاتی که شرایط ثبت اختراع را دارا می باشد به صورت اظهارنامه اختراع در اداره مربوطه ثبت و سپس نسبت به انتشار آنها اقدام کنند. امکان دارد مراحل ثبت اختراع چندین ماه به طول بیانجامد که انتشار مقاله (و مانند آن) پس از تاریخ ثبت اظهارنامه اختراع مشکلی را در فرآیند ثبت اختراع بوجود نمی آورد.

از آنجا که برخی دستاورد ها مانند روشهای تشخیص بیماری و نوآوری های مدیریتی قابلیت ثبت اختراع بین المللی و ملی را ندارند، محققان بدون نگرانی میتوانند انتشار در مقالات داخلی و خارجی را به عنوان اولین گزینه جهت کسب افتخار دست یابی به این قبیل پژوهشها انتخاب کنند.

 
برو بالا