استفاده از variplex ™ SARS-CoV-2 RT-LAMP به عنوان یک روش مولکولی سریع

استفاده از variplex ™ SARS-CoV-2 RT-LAMP به عنوان یک روش مولکولی سریع

نوع فایل : word

تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش : 21

تعداد کلمات : 3600

مجله : Journal of Clinical Virology

انتشار : 2020

ترجمه متون داخل جداول : ترجمه شده است

درج جداول در فایل ترجمه : درج شده است

منابع داخل متن : به صورت فارسی درج شده است

کیفیت ترجمه : طلایی

:

تاریخ انتشار
25 فوریه 2021
دسته بندی
تعداد بازدیدها
1172 بازدید
25,000 تومان
دانلود اصل مقاله

عنوان فارسی مقاله:استفاده از variplex ™ SARS-CoV-2 RT-LAMP به عنوان یک روش مولکولی سریع برای تکمیل RT-PCR برای تشخیص COVID-19

 چکیده

سابقه و هدف: سنجش های مولکولی مبتنی بر تقویت ایزوترمال واسطه با حلقه معکوس (RT-LAMP) به دلیل عملکرد آسان و گزینه ای که برای تشخیص سریع سندرم حاد تنفسی حاد  –   SARS-CoV-2) ممکن است مفید باشد.

اهداف: این مطالعه برای ارزیابی عملکرد بالینی روش variplex M دارای برچسب CE در زمان واقعی SARS-CoV-2 RT-LAMP در مقایسه با RT-PCR های تجاری طراحی شده است.

طراحی مطالعه: RNA استخراج شده از سواب حلق توسط ژن RT-PCR variplex ™ RT-LAMP و Corman’s Light- Mix ™ E مورد آزمایش قرار گرفت. نمونه ترشحات تنفسی از بیماری عفونت کرونا ویروس (COVID-19) و بیماران کنترل منفی توسط variplex ™ بدون استخراج RNA مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند و به طور موازی با Allplex ™ و VIASURE BD MAX RT-PCR آزمایش شدند.

یافته ها: با استفاده از RNA جدا شده variplex ™ RT-LAMP حساسیت ۷۵ درصد در مقایسه با ژن LightMix E RT-PCR نشان داد اما بر خلاف مورد دوم هیچ نتیجه مثبت کاذبی ایجاد نکرد. برای ارزیابی نمونه ها از تجزیه و تحلیل انطباق ترشحات تنفسی ، فقط یک توافق متوسط ​​بین variplex ™ RT-LAMP که روی نمونه های پردازش نشده و Allplex ™ و VIASURE RT-PCR انجام شد (κ Cohen از ۰٫۵۲-۰٫۵۵۶) نشان داد. با استفاده از رویکرد برای تعریف نمونه به عنوان مثبت مثبت در صورتی که حداقل دو سنجش نتیجه مثبت داد ، حساسیت های بالینی به شرح زیر بود: ۷۶٫۳ for برای variplex ™ ، ۸۴٫۲ for برای Allplex ™ و ۶۸٫۴ for برای VIASURE. با این حال ، هنگامی که نتایج RT-PCR و RT-LAMP ترکیب شدند حساسیت تشخیصی به ۹۲-۱۰۰٪ افزایش یافت.

نتیجه گیری: واریپلکس RT-LAMP ممکن است به عنوان یک آزمایش سریع همراه با روش RT-PCR برای افزایش دقت تشخیصی در بیماران مشکوک به عفونت COVID-19 باشد(استفاده از variplex ™ SARS-CoV-2 RT-LAMP).

ادامه مطلب

راهنمای خرید:
  • لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
  • همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
  • ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
  • در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.

Title: Use of the variplex™ SARS-CoV-2 RT-LAMP as a rapid molecular assay to complement RT-PCR for COVID-19 diagnosis

Abstract

 Background: Molecular assays based on reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) may be useful for rapid diagnosis of the severe acute respiratory syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) because of the easy performance and the option to bypass RNA extraction. Objectives: This study was designed to evaluate the clinical performance of the CE-labeled variplexTM real time SARS-CoV-2 RT-LAMP assay in comparison to commercial RT-PCRs. Study design: RNA extracted from pharyngeal swabs was tested by variplex™ RT-LAMP and Corman’s LightMix™ E gene RT-PCR as reference. Samples of respiratory secretions from Coronavirus infection disease (COVID- 19) and negative control patients were analyzed by variplex™ without RNA extraction and tested in parallel with the Allplex™ and VIASURE BD MAX RT-PCRs. Results: Using isolated RNA variplex™ RT-LAMP showed a sensitivity of 75 % compared to LightMix E gene RTPCR but contrary to the latter it produced no false-positive results. For the evaluation of samples from respiratory secretions concordance analysis showed only a moderate agreement between the variplex™ RT-LAMP conducted on unprocessed samples and Allplex™ and VIASURE RT-PCRs (Cohen’s κ ranging from 0.52− 0.56). Using the approach to define a sample as true-positive when at least two assays gave a positive result the clinical sensitivities were as follows: 76.3 % for variplex™, 84.2 % for Allplex™ and 68.4 % for VIASURE. However, when results of RT-PCR and RT-LAMP were combined diagnostic sensitivity was increased to 92–100 %. Conclusion: The variplex RT-LAMP may serve as a rapid test to be combined with a RT-PCR assay to increase the diagnostic accuracy in patients with suspected COVID-19 infection.