تجزیه و تحلیل تکاملی کل ژنوم ویروس کرونا (۲۰۱۹-nCoV) فرضیه ظهور بیماری

نوع فایل : word

تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش : 8

تعداد کلمات : 2700

مجله : Infection, Genetics and Evolution

انتشار : 2020

ترجمه متون داخل جداول : ترجمه شده است

درج جداول در فایل ترجمه : درج شده است

منابع داخل متن : به صورت فارسی درج شده است

کیفیت ترجمه : طلایی

:

تاریخ انتشار
20 می 2021
دسته بندی
تعداد بازدیدها
1277 بازدید
20,000 تومان

عنوان فارسی مقاله:تجزیه و تحلیل تکاملی کل ژنوم ویروس کرونا (۲۰۱۹-nCoV) فرضیه ظهور بیماری را در نتیجه یک رویداد نوترکیبی رد می کند

 چکیده

 سابقه و هدف: اخیراً کرونا ویروس (۲۰۱۹-nCoV) با انتقال انسان به انسان و عفونت شدید انسانی از شهر ووهان در چین گزارش شده است. اهداف ما توصیف روابط ژنتیکی ۲۰۱۹-nCoV و جستجوی نوترکیبی قلمداد شده در زیرشاخه سار-بکوویروس بود.

روش‌ها: نوترکیب توسط RDP4 و Simplot v3.5.1 بررسی شد و خوشه بندی فیلوژنتیک ناسازگار در قطعات جداگانه ژنومی با استفاده از تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک با استفاده از حداکثر درست نمایی و روشهای بیزی تأیید شد.

یافته‌ها: تجزیه و تحلیل ما نشان می‌دهد که ۲۰۱۹-nCoV گرچه از نزدیک با توالی BatCoV RaTG13 در کل ژنوم مرتبط است (تشابه توالی ۹۶٫۳٪)، خوشه بندی ناسازگار با توالی‌های ویروسی کرونا مانند Bat_SARS را نشان می‌دهد. به طور خاص، در ۵′ قسمت پوششی ۱۱،۴۹۸ نوکلئوتیدی اولیه و ۳′ قسمت آخر ۲۴،۳۴۱–۳۰،۶۹۶ موقعیت، ۲۰۱۹-nCoV و RaTG13 یک خوشه واحد با موارد ویروس کرونا ویروس Bat_SARS تشکیل داده‌اند، در حالی که در منطقه وسط قرار دارند. ۳′ انتهای ORF1a، ORF1b و تقریباً نیمی از مناطق خوشه، ۲۰۱۹-nCoV و RaTG13 در یک نژاد دور جداگانه در شاخه ویروس ساربکو ویروس قرار گرفته‌اند.

 نتیجه گیری: سطح تشابه ژنتیکی بین ۲۰۱۹-nCoV و RaTG13 نشان می‌دهد که مورد دوم دقیقاً نوع ایجاد شیوع در انسان را ارائه نمی‌دهد، اما این فرضیه که ۲۰۱۹-nCoV از خفاش‌ها منشأ گرفته است بسیار محتمل است. ما شواهدی را نشان می‌دهیم که کرونا ویروس (۲۰۱۹-nCov) موزاییکی نیست که تقریباً در نیمی از ژنوم آن از یک نژاد مشخص در ویروس بتاکورونا تشکیل شده است. این ویژگی‌های ژنومی و ارتباط بالقوه آنها با ویژگی‌های ویروس و شیوع در انسان نیاز به توجه بیشتری دارد(تحلیل تکاملی کل ژنوم ویروس کرونا).

ادامه مطلب

راهنمای خرید:
  • لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
  • همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
  • ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
  • در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.

Title: Full-genome evolutionary analysis of the novel corona virus (2019-nCoV) rejects the hypothesis of emergence as a result of a recent recombination event

Abstract

 Background: A novel coronavirus (2019-nCoV) associated with human to human transmission and severe human infection has been recently reported from the city of Wuhan in China. Our objectives were to characterize the genetic relationships of the 2019-nCoV and to search for putative recombination within the subgenus of sarbecovirus. Methods: Putative recombination was investigated by RDP4 and Simplot v3.5.1 and discordant phylogenetic clustering in individual genomic fragments was confirmed by phylogenetic analysis using maximum likelihood and Bayesian methods. Results: Our analysis suggests that the 2019-nCoV although closely related to BatCoV RaTG13 sequence throughout the genome (sequence similarity 96.3%), shows discordant clustering with the Bat_SARS-like coronavirus sequences. Specifically, in the 5′-part spanning the first 11,498 nucleotides and the last 3′-part spanning 24,341–30,696 positions, 2019-nCoV and RaTG13 formed a single cluster with Bat_SARS-like coronavirus sequences, whereas in the middle region spanning the 3′-end of ORF1a, the ORF1b and almost half of the spike regions, 2019-nCoV and RaTG13 grouped in a separate distant lineage within the sarbecovirus branch. Conclusions: The levels of genetic similarity between the 2019-nCoV and RaTG13 suggest that the latter does not provide the exact variant that caused the outbreak in humans, but the hypothesis that 2019-nCoV has originated from bats is very likely. We show evidence that the novel coronavirus (2019-nCov) is not-mosaic consisting in almost half of its genome of a distinct lineage within the betacoronavirus. These genomic features and their potential association with virus characteristics and virulence in humans need further attention.