عنوان فارسی مقاله:تجزیه و تحلیل تکاملی کل ژنوم ویروس کرونا (۲۰۱۹-nCoV) فرضیه ظهور بیماری را در نتیجه یک رویداد نوترکیبی رد می کند
چکیده
سابقه و هدف: اخیراً کرونا ویروس (۲۰۱۹-nCoV) با انتقال انسان به انسان و عفونت شدید انسانی از شهر ووهان در چین گزارش شده است. اهداف ما توصیف روابط ژنتیکی ۲۰۱۹-nCoV و جستجوی نوترکیبی قلمداد شده در زیرشاخه سار-بکوویروس بود.
روشها: نوترکیب توسط RDP4 و Simplot v3.5.1 بررسی شد و خوشه بندی فیلوژنتیک ناسازگار در قطعات جداگانه ژنومی با استفاده از تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک با استفاده از حداکثر درست نمایی و روشهای بیزی تأیید شد.
یافتهها: تجزیه و تحلیل ما نشان میدهد که ۲۰۱۹-nCoV گرچه از نزدیک با توالی BatCoV RaTG13 در کل ژنوم مرتبط است (تشابه توالی ۹۶٫۳٪)، خوشه بندی ناسازگار با توالیهای ویروسی کرونا مانند Bat_SARS را نشان میدهد. به طور خاص، در ۵′ قسمت پوششی ۱۱،۴۹۸ نوکلئوتیدی اولیه و ۳′ قسمت آخر ۲۴،۳۴۱–۳۰،۶۹۶ موقعیت، ۲۰۱۹-nCoV و RaTG13 یک خوشه واحد با موارد ویروس کرونا ویروس Bat_SARS تشکیل دادهاند، در حالی که در منطقه وسط قرار دارند. ۳′ انتهای ORF1a، ORF1b و تقریباً نیمی از مناطق خوشه، ۲۰۱۹-nCoV و RaTG13 در یک نژاد دور جداگانه در شاخه ویروس ساربکو ویروس قرار گرفتهاند.
نتیجه گیری: سطح تشابه ژنتیکی بین ۲۰۱۹-nCoV و RaTG13 نشان میدهد که مورد دوم دقیقاً نوع ایجاد شیوع در انسان را ارائه نمیدهد، اما این فرضیه که ۲۰۱۹-nCoV از خفاشها منشأ گرفته است بسیار محتمل است. ما شواهدی را نشان میدهیم که کرونا ویروس (۲۰۱۹-nCov) موزاییکی نیست که تقریباً در نیمی از ژنوم آن از یک نژاد مشخص در ویروس بتاکورونا تشکیل شده است. این ویژگیهای ژنومی و ارتباط بالقوه آنها با ویژگیهای ویروس و شیوع در انسان نیاز به توجه بیشتری دارد(تحلیل تکاملی کل ژنوم ویروس کرونا).
- لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
- همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
- ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
- در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.