توالی یابی به روش پایرو سکیوانسینگ ترانسکریپت روده سوسکچه های خرطوم دار موز

نوع فایل : word

تعداد صفحات ترجمه تایپ شده با فرمت ورد با قابلیت ویرایش : 16

تعداد کلمات : 5000

مجله : plos

انتشار : 2016

ترجمه متون داخل جداول : ترجمه شده است

درج جداول در فایل ترجمه : درج شده است

منابع داخل متن : به صورت فارسی درج شده است

کیفیت ترجمه : طلایی

:

تاریخ انتشار
30 مارس 2021
دسته بندی
تعداد بازدیدها
1104 بازدید
22,000 تومان

عنوان فارسی مقاله:توالی یابی به روش پایرو سکیوانسینگ ترانسکریپت روده سوسکچه های خرطوم دار موز حاکی از رونوشت‌های شبه پروتئاز چندگانه است

چکیده

سوسکچه های خرطوم دار موز یک آفت حشره‌ای مهم در بسیاری از مناطق کشت موز و موز سبز در دنیا است. علی رغم اهمیت اقتصادی این حشره آفت، اطلاعات ژنومی و رونوشتی کمی برای این گونه وجود دارد. در این مطالعه، ما ترانسکریپتوم روده C. sordidus(سوسکچه های خرطوم دار) را با استفاده از پیرو توالی یابی ۴۵۴ مشخص کردیم.۵۹۰۰۰۰ قطعه توالی تولید شد که به ۳۰۸۴۰ کانتیگ با بیش از ۴۰۰ bp مونتاژ شد که بیانگر توسعه قابل توجه توالی‌های موجود برای این آفت است. در این میان ۱۶۴۲۷ کانتیک شامل یک یا چند GO است. به علاوه،۱۵۶۲۳ کانتیگ یک عدد EC را داشتند. تحلیل ترانسکریپتوم عمیق، ژن‌های دخیل در مقاومت آفت کش به شناسایی بیوسنتز غشای پری تروفیک، عملکرد مربوط به ایمنی و دفاع در برابر پاتوژن ها و پروتین های پیوندی توکسین Bacillus thuringiensis و نیز آنزیم‌های متعدد درگیر هضم پروتینی کمک کرد. این ترانسکریپتوم یک منبع ارزشمند را برای درک فیزیولوژی لارو و شناسایی سایت‌های هدف جدید و رویکردهای مدیریتی برای این آفت حشره‌ای مهم در اختیار گذاشت(روده سوسکچه های خرطوم دار موز).

ادامه مطلب

راهنمای خرید:
  • لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
  • همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
  • ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
  • در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.

Title: Pyrosequencing the Midgut Transcriptome of the Banana Weevil Cosmopolites sordidus (Germar) (Coleoptera: Curculionidae) Reveals Multiple Protease-Like Transcripts

Abstract

The banana weevil Cosmopolites sordidus is an important and serious insect pest in most banana and plantain-growing areas of the world. In spite of the economic importance of this insect pest very little genomic and transcriptomic information exists for this species. In the present study, we characterized the midgut transcriptome of C. sordidus using massive 454-pyrosequencing. We generated over 590,000 sequencing reads that assembled into 30,840 contigs with more than 400 bp, representing a significant expansion of existing sequences available for this insect pest. Among them, 16,427 contigs contained one or more GO terms. In addition, 15,263 contigs were assigned an EC number. In-depth transcriptome analysis identified genes potentially involved in insecticide resistance, peritrophic membrane biosynthesis, immunity-related function and defense against pathogens, and Bacillus thuringiensis toxins binding proteins as well as multiple enzymes involved with protein digestion. This transcriptome will provide a valuable resource for understanding larval physiology and for identifying novel target sites and management approaches for this important insect pest