عنوان فارسی مقاله:مشخصات ژنومیک و اپیدمولوژی کروناویروس جدید ۲۰۱۹: اهمیت آن برای تشخیص منشأ ویروس و اتصال گیرنده
چکیده
پیش زمینه و هدف: در اواخر دسامبر ۲۰۱۹، بیماران دارای پنومونی ویروسی به دلیل عامل میکروبی ناشناخته در ووهان چین گزارش شد. کروناویروس جدید به عنوان پاتوژن بیماری زا در نظر گرفته شد و به نام کروناویروس ۲۰۱۹(۲۰۱۹-nCoV) در نظر گرفته شد. از ۲۶ ژوئن ۲۰۲۰، بیش از ۲۰۰۰ مورد کروناوروس تأیید شد که بیشتر آنها افراد ساکن یا مسافران در ووهان بودندو انتقال انسان به انسان نیز تأیید شد.
روشها: توالی یابی نسل جدید نمونهها از مایع لاواژ برانکوالوئولار و ایزولههای کشت شده از نه بیمار بستری انجام شد که هشت نفر آنها از بازار غذاهای دریایی در ووهان بازدید کردند. توالی ژنوم کامل و جزئی ۲۰۱۹-nCoV از این افراد بدست آمد. پیوندهای ویروسی با استفاده از توالی Sanger برای به دست آوردن ژنوم تمام طول، با مناطق انتها تعیین شده توسط تقویت سریع انتهای cDNA، متصل شدند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک این ژنوم های ۲۰۱۹-nCoV و سایر کورو ویروسها برای تعیین تاریخچه تکامل ویروس و کمک به استنباط از منشأ احتمالی آن استفاده شد. مدل سازی هومولوژی برای کشف ویژگیهای احتمالی گیرنده اتصال ویروس انجام شد.
یافتهها: ده توالی ژنوم از ۲۰۱۹-nCoV به دست آمده از نه بیمار بسیار مشابه بود، و تشابه توالی ۹۹٫۹۸ درصد را شان داد نکته قابل توجه، ۲۰۱۹-nCoV از نزدیک (با هویت ۸۸٪) به دو سندرم حاد تنفسی حاد (SARS) مشتق شده از خفاش،-SL-CoVZC45 و bat-SL-CoVZXC21، جمع آوری شده در سال ۲۰۱۸ در ژوشان، شرق چین مرتبط بود. اما از SARS-CoV (حدود ۷۹٪) و MERS-CoV (حدود ۵۰٪) فاصله داشت. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک نشان داد که ۲۰۱۹-nCoV در زیر سن Sarbecovirus از جنس Betacoronavirus قرار گرفت، با طول شاخه نسبتاً طولانی به نزدیکترین بستگان خود خفاش-SL-CoVZC45 و bat-SL-CoVZXC21، و از نظر ژنتیکی با SARS-CoV متمایز بود. نکته قابل توجه، مدل سازی هومولوژی نشان داد که ۲۰۱۹-nCoV با وجود تغییر اسید آمینه در برخی از باقیماندههای کلیدی، یک ساختار دامنه اتصال دهنده گیرنده مشابه آن با SARS-CoV دارد(مشخصات ژنومیک و اپیدمولوژی کروناویروس جدید).
تفسیر: ۲۰۱۹-nCoV به اندازه کافی از SARS-CoV متفاوت است تا یک بتاکورونوویروس جدید آلوده به انسان در نظر گرفته شود. اگرچه تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک ما نشان میدهد که خفاشها ممکن است میزبان اصلی این ویروس هستند یک حیوان که در بازار غذاهای دریایی در ووهان فروخته میشود ممکن است یک میزبان واسطه باشد که باعث ظهور ویروس در انسان میشود. نکته مهم، تجزیه و تحلیل ساختاری نشان میدهد که ۲۰۱۹-nCoV ممکن است بتواند به گیرنده آنزیم ۲ تبدیل کننده آنژیوتانسین در انسان متصل شود. تکامل، سازگاری و گسترش آینده این ویروس، نیازمند تحقیقات فور است.
- لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
- همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
- ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
- در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.