عنوان فارسی مقاله:اصلاح و بازسازی توالی رونوشت یا ترانسکریپت جدید از RNA-Seq: تولید و تحلیل مرجع با Trinity
چکیده
جمع آوری داده ها از RNA-Seq به ما امکان می دهد بدون نیاز به توالی ژنوم ، از جمله در ارگانیسم های غیر مدل از اهمیت اکولوژیکی و تکاملی ، نمونه های سرطانی یا میکروبیوم ، مطالعه رونوشت های موجود را مطالعه کنیم. در این پروتکل ، ما استفاده از پلتفرم Trinity را برای رونویسی جدید از داده های RNA-Seq در موجودات غیر مدل توصیف می کنیم. ما همچنین برنامه های همراه پشتیبانی Trinity را برای برنامه های پایین دست ، از جمله RSEM برای برآورد فراوان v,k,aj ، بسته های R / Bioconductor برای شناسایی رونوشت های بیان شده متفاوت در نمونه ها ، و روش هایی برای شناسایی ژن های کد کننده پروتئین ارائه می دهیم(اصلاح وبازسازی توالی رونوشت یا ترانسکریپت). در یک آموزش شامل ما یک گردش کار برای تجزیه و تحلیل رونویسی مستقل از ژنوم با استفاده از پلت فرم Trinity ارائه می دهیم(اصلاح وبازسازی توالی رونوشت یا ترانسکریپت).
- لینک دانلود فایل بلافاصله بعد از پرداخت وجه به نمایش در خواهد آمد.
- همچنین لینک دانلود به ایمیل شما ارسال خواهد شد به همین دلیل ایمیل خود را به دقت وارد نمایید.
- ممکن است ایمیل ارسالی به پوشه اسپم یا Bulk ایمیل شما ارسال شده باشد.
- در صورتی که به هر دلیلی موفق به دانلود فایل مورد نظر نشدید با ما تماس بگیرید.